河流千余条，分归鸭绿江、松花江水系。最大河流有鸭绿江、浑江、辉发河。中朝界河鸭绿江流经通化市至辽宁省丹东市入黄海，境内流长203.5公里，流域面积3.2万平方公里。浑江流经白山、通化、桓仁、集安汇入鸭绿江，流域面积4371平方公里。辉发河系属松花江水系主要支流，沿龙岗山脉东北流向，经柳河、梅河口、辉南、桦甸入第二松花江，境内流长112公里，流域面积1.04平方公里。

　　市商品鱼产量15370吨，其中养殖产量14240吨，捕捞产量1130吨。鱼种生产1121吨，鱼苗生产3亿尾。全市总经营面积为1530793公顷。其中，林地面积为1045263公顷，占总经营面积的62.28%。有林地面积为935113公顷，占林地面积的89.46%。全市森林覆盖率为63%。

　　药物资源有植物药、动物药和矿物药，是全国“五大药库”之一。已经查明的药物资源252科、596属、1133种，主要有人参、天麻、贝母、五味子、红景天等。

　　食物资源有蕨菜、薇菜、蒲公英、桔梗、元蘑等190余种野生植物。还有林蛙、蜂蜜、花粉、天然色素和矿泉水等资源。

　　矿产资源已经发现75种，探明储量34种，24亿余吨，潜在价值260亿元。通化地处长白山区和鸭绿江开发带，主要有龙湾火山群、罗通山、五女峰等奇特的自然景观，有6000年前王八脖子原始文化遗址、杨靖宇烈士陵园等人文、历史景观。集安市有独具特色的高句丽古迹，全市有国家级森林公园4处，旅游资源丰富。