吉林省鼓励外商投资化学原料药、医药专用中间体氨基酸类产品、药品制剂新剂型、新品种及相关辅料、中药、鹿茸产品开发、生物药、医疗器械等产业。
吉林省医药工业20多年的增长速度超过了中国的平均水平，是吉林省工业部门中发展快、效益好、发展潜力大、最具有发展前景的优势产业之一。主要包括化学原料药及制剂、中药材、中药饮片、中成药、抗生素、生物制品、生化药品、放射性药品、医疗器械、卫生材料、制药机械、药用包装材料及医药商业等门类，现已形成以中成药为主，生物制药为辅，化学制药和医疗器械等补充的较为合理的产业格局。其中生物制药产业、中药加工业优势明显，整体水平居国内领先。吉林省现有医药工业企业231户，职工人数5万余人，资产总额282亿元，其中有203户企业通过GMP认证，占吉林省统计范围的94％，高于中国平均水平。中成药13个剂型，产量2万吨；化学原料药10大类、29个品种，产量8765吨；化学制剂7种。在中国医药工业主要经济指标排序中，吉林省中成药工业产值和利润总额均列中国第一位，产品销售收入列中国第二位。
吉林省共有药用动植物和矿物资源1850种，占中国品种总量的三分之一。其蕴藏量占中国50％以上的品种约40多个。吉林省是国家生物技术及产业的四大“聚集区”之一，拥有在国内有影响的长春生物制品研究所等18个生物技术实验室、教研室和中试基地，拥有吉林中医中药研究院等较强的中药研发能力。
发展方向及目标：依托长白山北药资源和生物技术优势，着力提高自主研发能力，全面完成企业GMP改造，大力发展现代中药和生物药产业。壮大通化、敦化两大药城，建设长春、吉林医药产业园区，发展吉林修正、通化东宝、延边敖东、长生基因等10个制药集团。开发具有自主知识产权的医药新品种50个。到2010年医药工业销售收入预期达到500亿元以上，年均增长20％。现代中药产业。采用生物技术、化合物提取和筛选技术、标准化检测技术，集中力量开发具有自主知识产权和较高技术含量的国家一、二类中药新药；大力发展疗效显著、产品附加值高的中药新产品；扩大一批量大面广的传统中药产品。加快推进中药材种植GAP、中成药生产GMP标准化和规范化，建设10个中药材种植基地、10个中药饮片加工基地。生物药产业。围绕生物技术制药和生物制品制药，加快开发和引进基因重组技术、单细胞融合技术、酶工程和现代生物发酵技术，重点发展生物疫苗、基因工程药和生物中药，扩大人胰岛素、人生长素、干扰素、干细胞等生物药品生产。